After Nowak, 1991, and Martín-Suárez & Mein, 1998

<==o Apodemus Kaup, 1826; U.Mioc.-R. As. Eu., L.-U.Plioc., U.Pleist.-R. Af., ?Plioc.-R. Mid. (field mice; peltohiiret) [taxonomic history] [21]
   |--+-- †A. atavus Heller, 1936 [incl. †Apodemus dominans Kretzoi, 1959]
   |  `--+-- A. flavicollis (Melchior, 1834) (metsähiiri)
   |     `--o A. sylvaticus (Linnaeus, 1758) (pikkumetsähiiri)
   |        |-- A. s. sylvaticus (pikkumetsähiiri)
   |        `-- A. s. krkensis (krksaarenhiiri)
   `--+-- †A. lugdunensis (Schaub, 1938) Martín-Suárez & Mein, 1998 [Parapodemus lugdunensis Schaub, 1938] [incl. Parapodemus albae Kretzoi, 1951 sensu Martín-Suárez & Mein, 1998]
      `--+--+-- †A. barbarae (Van De Weerd, 1976) Martín-Suárez & Mein, 1998 [Parapodemus gaudryi barbarae Van De Weerd, 1976]
         |  `--+-- †A. meini (Martín-Suárez & Freudenthal, 1993) Martín-Suárez & Mein, 1998 [Parapodemus meini Martín-Suárez & Freudenthal, 1993]
         |      `-- †A. sp. “Lissieu”
         `--+--+-- †A. gudrunae Van De Weerd, 1976
            |  `-- †A. sp. “Celleneuve-Hautimagne-C. Mahora”
            `--+--+--+-- †A. gorafensis Ruiz Busos et al., 1984
               |  |  `-- A. mystacinus (Dandford & Alston, 1877) (kalliohiiri)
               |  `-- †A. agustii Martín-Suárez, 1988
               `-- †A. jeanteti Michaux, 1969

Apodemus -species listed:

A. alsomioides Schaub, 1938
    †A. caesareanus Bate, 1942)
    †A. debruijni Kotlia, 1992
    †A. etruscus Engesser,1989
    †A. leptodus Kretzoi, 1956
    †A. levantinus Bate, 1942
    †A. lewisi Newton, 1899
    †A. maastrichtiensis Van Kolfschoten, 1985 [=? “Parapodemus” coronensis Schaub, 1938 (in partim)]
    †A. manu Thaler, 1974
    †A. maximus Thaler, 1972
    †A. microps Kratochvil & Rosicky, 1952
    †A. mirabilis (Shevchenko, 1965)
    †A. orientalis (Schaub, 1938) Storch, 1987 [Progonomys orientalis Schaub, 1938; Parapodemus orientalis (Schaub) Thaler, 1966]
    †A. qiui Wu Wenyu & Flynn, 1991
    †A. schaubi (Papp, 1947) Martín-Suárez & Mein, 1998 [Parapodemus schaubi Papp, 1947]
    †A. whitei Hinton, 1915
    †A. zhangwagouensis Wu Wenyu & Flynn, 1991
    A. agrarius (Pallas, 1778) [Mus agrarius Pallas, 1778] (field mouse; peltohiiri)
    A. alpicola
    A. argenteus
    A. arianus
    A. chevrieri
    A. draco
    A. fulvipectus
    A. gurkha
    A. hermonensis
    A. hyrcanicus
    A. latronum
    A. peninsulae Thomas, 1906
    A. ponticus
    A. rusiges
    A. semotus
    A. speciosus
    A. uralensis (idänmetsähiiri)
    A. wardi

Incertae sedis:

Parapodemus jordanicus Haas, 1966 [a digested Apodesmus (Martín-Suárez & Mein, 1998)]

Reference(s):