After Duellman, Trueb & Lehr, 2006, and Frost et al., 2006, with species from Frost, 2000-2002 [“AMNH Amphibian species of the World”]

<==o Amphignathodontidae Boulenger, 1882 [taxonomic history]
   |--o Flectonotus Miranda-Ribeiro, 1920
   |  |?- F. fissilis
   |  |?- F. fitzgeraldi
   |  |-- F. pygmaeus
   |  `--+-- F. goeldii
   |     `-- F. ohausi
   `--o Gastrotheca [paraphyletic, if Hemiphractus exclueded (Mendelson et al., 2000), Hemiphractus removed and transferred to Hemiphractidae Peters, 1862 by Frost et al. (2006)]
      |?- G. abdita
      |?- G. albolineata
      |?- G. andaquiensis
      |?- G. angustifrons
      |?- G. antomia
      |?- G. atympana
      |?- G. aureomaculata
      |?- G. bufona
      |?- G. carinaceps Duellman, Trueb & Lehr, 2006
      |?- G. christiani
      |?- G. chrysosticta
      |?- G. dunni
      |?- G. espeletia
      |?- G. excubitor
      |?- G. gracilis
      |?- G. griswoldi
      |?- G. helenae
      |?- G. lateonota
      |?- G. lauzurica
      |?- G. litonedis
      |?- G. longipes
      |?- G. marsupiata
      |?- G. nicefori
      |?- G. ochoai
      |?- G. orophylax
      |?- G. pacchamama
      |?- G. peruana
      |?- G. pseustes
      |?- G. psychrophila
      |?- G. rebeccae
      |?- G. ruizi
      |?- G. splendens
      |?- G. stictopleura
      |?- G. testudinea
      |?- G. trachyceps
      |?- G. walkeri
      |?- G. weinlandii
      |?- G. williamsoni
      |?- G. zeugocystis
      |--+--+-- G. microdiscus [G. microdisca]
      |  |  `-- G. fissipes
      |  `--+-- G. dendronastes
      |     `-- G. cornuta
      `--+-- G. argenteovirens
         |-- G. plumbea
         |-- G. riobambae
         `--+-- G. monticola
            `--+-- G. ovifera
               `--+-- G. galeata
                  `-- G. guentheri

Reference(s):