After McKenna & Bell, 1997, with recent species from Nowak, 1991

<==o Neotomini Merriam, 1894 [taxonomic history]
   |-- Xenomys nelsoni Merriam, 1892; R. SNA. (magdalenarotta)
   |--+--o †Repomys May, 1981; U.Mioc.-U.Plioc. NA.
   |  |  |-- †R. gustelyi May, 1981 [type]
   |  |  `--+-- †R. maxumi May, 1981
   |  |     `-- †R. panacaensis May, 1981
   |  `?-o Nelsonia Merriam, 1897; R. SNA.
   |     |-- N. neotomodon (pikkurotta)
   |     `?- N. goldmani ()?
   `--+--o †Galushamys Jacobs, 1977; U.Mioc. NA.
      |  `-- †G. redingtonensis
      |?-o †Neotomodon
      |  `-- †N. alstoni
      |-- Hodomys alleni Merriam, 1894; R. SNA. [sgen.=>Neotoma?] (alleninrotta)
      `--o Neotoma Say & Ord, 1825 [Nectoma Agassiz, 1842 (lapsus calami)] [incl. Teonoma Gray, 1843; Teanopus Merriam, 1903; Homodontomys Goldman, 1910; †Parahodomys Gidley & Gazin, 1933; †Paraneotoma Hibbard, 1967] U.Mioc.-R. NA., R. CA. (Wood rats, Pack rats)
         |?- †N. quadriplicata (Hibbard, 1941)
         |?- †N. leucopetrica
         |-- N. (Teonoma) cinerea (pohjankauppiasrotta)
         |-- N. (Teanopus) phenax ()?
         `--o N. (Neotoma) Say & Ord, 1825
            |--o N. (N.) floridana (idänkauppiasrotta)
            |  |-- N. (N.) f. floridana ()?
            |  `-- N. (N.) f. smalli ()?
            |-- N. (N.) micropus ()?
            |-- N. (N.) albigula ()?
            |-- N. (N.) nelsoni ()?
            |-- N. (N.) palatina ()?
            |-- N. (N.) varia ()?
            |-- N. (N.) lepida (aavikkokauppiasrotta)
            |?- N. (N.) devia [ssp.=>N. lepida] ()?
            |-- N. (N.) bryanti ()?
            |-- N. (N.) anthonyi ()?
            |-- N. (N.) martinensis()?
            |-- N. (N.) bunkeri ()?
            |-- N. (N.) stephensi ()?
            |-- N. (N.) goldmani ()?
            |-- N. (N.) mexicana ()?
            |-- N. (N.) chrysomelas ()?
            |-- N. (N.) angustapalata ()?
            `--o N. (N.) fuscipes ()?
               |--  N. (N.) f. fuscipes ()?
               `--  N. (N.) f. riparia ()?

Reference(s):