After Hutchinson, Skinner, & Lee, 2012, with species from Uetz, Etzold & Chenna, 1995– [“The Reptile Database” (former EMBL Reptile Database)

<==o Agamidae Gray, 1827 (agamat)
   |?-o †Tinosaurus Marsh, 1872; Paleoc.-Eoc. SAs., Eoc. EAs. NA. Eu. Ind.
   |  |-- †T. stenodon Marsh, 1872
   |  |-- †T. asiaticus Gilmore, 1943
   |  |-- †T. indicus Prasad & Bajpai, 2008
   |  `-- †T. europeocaenus Augé & Smith, 1997
   |-- †Vastanagama susani Prasad & Bajpai, 2008; E.Eoc. Ind.
   |-- Leiolepinae [Uromastycinae]
   `--o Agaminae
      |--+--o Hydrosaurus
      |  |  |-- H. amboinensis (purjeagama)
      |  |  |-- H. pustulatus
      |  |  `-- H. weberi
      |  `--+--+-- Agama Paleoc. SAs., ?U.Eoc. or L.Olig.-U.Mioc. Eu. Af.
      |     |  `--o Trapelus
      |     |     |-- T. agilis
      |     |     |-- T. blanfordi
      |     |     |-- T. flavimaculatus
      |     |     |-- T. jayakari
      |     |     |-- T. megalonyx
      |     |     |-- T. microtympanum
      |     |     |-- T. mutabilis
      |     |     |-- T. pallidus
      |     |     |-- T. persicus
      |     |     |-- T. rubrigularis
      |     |     |-- T. ruderatus
      |     |     |-- T. sanguinolentus
      |     |     |-- T. savignyi
      |     |     `-- T. tournevillei
      |     `--+-- Laudakia
      |        `-- Phrynocephalus
      `--+--o “Draconines”
         |  |-- Draco (liitoliskot; flying lizards)
         |  `--+-- †Tikiguana estesi Datta & Ray, 2006; L.Trias. Ind. [Validity questionable, reburied relatively recent specimen. (Hutchinson et al., 2012)]
         |     |-- Calotes (loistoagamat)
         |     `--+-- Japalura
         |        `--o Pseudocalotes [incl. Paracalotes]
         |           |-- P. brevipes
         |           |-- P. flavigula
         |           |-- P. floweri
         |           |-- P. microlepis
         |           |-- P. poilani (Bourret, 1939) [Paracalotes poilani Bourret, 1939; Pseudocalotes poilani (Bourret) Hallermann & Böhme, 2000]
         |           |-- P. saravacensis
         |           `-- P. tympanistriga
         `--+-- Physignathus cocincinus
            `--+-- Ctenophorus
               `--+--+--o Amphibolurus (partaliskot)
                  |  |  |-- A. muricatus
                  |  |  |-- A. nobbi
                  |  |  `-- A. norrisi
                  |  `--+-- “Physignathus” lesueurii (vesiagama)
                  |     `--+-- Moloch horridus (molok; piikkipiru)
                  |        `--o Hypsilurus
                  |           |-- H. auritus
                  |           |-- H. binotatus
                  |           |-- H. boydii
                  |           |-- H. bruijni
                  |           |-- H. dilophus
                  |           |-- H. geelvinkianus
                  |           |-- H. godeffroyi
                  |           |-- H. modestus
                  |           |-- H. nigrigularis
                  |           |-- H. nigrilabris
                  |           |-- H. papuensis
                  |           |-- H. schoedei
                  |           `-- H. spinipes
                  `--+--o Tympanocryptis
                     |  |-- T. adelaidensis
                     |  |-- T. butleri
                     |  |-- T. cephalus
                     |  |-- T. intima
                     |  |-- T. lineata
                     |  |-- T. parviceps
                     |  |-- T. tetraporophora
                     |  `-- T. uniformis
                     `--+-- Rankinia diemensis (Gray, 1841) [Tympanocryptis diemensis] (Mountain Heath Dragon, Mountain Dragon )
                        `--+--o Pogona
                           |  |-- P. barbata
                           |  |-- P. brevis
                           |  |-- P. henrylawsoni
                           |  |-- P. microlepidota
                           |  |-- P. minima
                           |  |-- P. minor
                           |  |-- P. mitchelli
                           |  |-- P. nullarbor
                           |  `-- P. vitticeps
                           `--o Diporiphora
                              |-- D. albilabris
                              |-- D. arnhemica
                              |-- D. australis
                              |-- D. bennettii
                              |-- D. bilineata
                              |-- D. convergens
                              |-- D. lalliae
                              |-- D. linga
                              |-- D. magna
                              |-- D. margaretae
                              |-- D. pindan
                              |-- D. reginae
                              |-- D. superba
                              |-- D. valens
                              `-- D. winneckei

Untreated Agamidae

    Acanthocercus
        A. adramitanus
        A. annectens
        A. atricollis
        A. cyanogaster
        A. phillipsii
        A. trachypleurus
        A. yemensis 
        A. zonurus
    Acanthosaura
        A. armata
        A. capra
        A. crucigera
        A. lepidogaster
    Aphaniotis
        A. acutirostris
        A. fusca
        A. nasuta
        A. ornata
    Brachysaura minor
    Bronchocela
        B. celebensis
        B. cristatella
        B. danieli
        B. hayeki
        B. jubata
        B. marmorata
        B. orlovi Hallermann & Orlov, in Hallermann, 2005
        B. smaragdina
    Bufoniceps laungwalaensis
    Caimanops amphiboluroides
    Ceratophora
        C. aspera
        C. erdeleni
        C. karu
        C. stoddartii
        C. tennentii
    Chelosania brunnea
    Chlamydosaurus kingii Pleist. R. Aus. (kauluslisko)
    Cophotis (kuuroagamat)
        C. ceylanica (kuuroagama)
        C. sumatrana [Pseudocophotis sumatrana] (sumatrankuuroagama)
    Coryophophylax
    Cryptagama aurita
    Dendragama boulengeri
    Gonocephalus
        G. bellii
        G. beyschlagi
        G. borneensis
        G. chamaeleontinus
        G. doriae
        G. grandis
        G. interruptus
        G. klossi
        G. kuhlii
        G. lacunosus
        G. liogaster
        G. megalepis
        G. mjoebergi
        G. robinsonii
        G. schultzewestrumi
        G. semperi
        G. sophiae
    Harpesaurus
        H. beccarii
        H. borneensis
        H. ensicauda
        H. modigliani
        H. thescelorhinos
        H. tricinctus
    Lophocalotes ludekingi
    Lophognathus
        L. gilberti
        L. longirostris
        L. maculilabris
        L. temporalis
    Lyriocephalus scutatus
    Mictopholis austeniana
    Oreodeira gracilipes
    Oriocalotes paulus
    Otocryptis
        O. beddomii
        O. nigrostigma Bahir & Silva, 2005
        O. wiegmanni
    Phoxophrys
        P. borneensis
        P. cephalum
        P. nigrilabris
        P. spiniceps
        P. tuberculata
    Psammophilus
        P. blanfordanus
        P. dorsalis
    Pseudotrapelus sinaitus
    Ptyctolaemus
        P. gularis
        P. phuwuanensis
    Salea
        S. anamallayana
        S. brachydactyla
        S. gularis
        S. horsfieldii
        S. kakhienensis
    Stellagama [Stellio] Pleist. SWAs. R. Eu. WAs. NAf.
        S. stellio (Llinnaeus, 1758)
            S. s. brachydactyla (Haas, 1951)
            S. s. cypriaca (Daan, 1967)
            S. s. daani (Beutler & Frör, 1980)
            S. s. picea (Parker, 1935)
            S. s. salehi Werner in Lachmann et al., 2006
            S. s. stellio (Linnaeus, 1758)
            S. s. vulgaris (Sonnini & Latreille, 1802)
    Sitana
        S. fusca
        S. ponticeriana
        S. sivalensis
    Xenagama
        X. batillifera
        X. taylori

Reference(s):