PROTEIINIEN RAKENNE JA TOIMINTA

Eliöiden toiminta ja rakentuminen perustuu ratkaisevasti proteiinimolekyylien spesifisiin vuorovaikutuksiin toistensa ja muiden biomolekyylien kanssa. Biologisen säätelyn, aineenvaihdunnan ja solujen välisen viestinnän syvällisempi ymmärtäminen edellyttääkin proteiinien rakenteen ja toiminnan yksityiskohtaisempaa tarkastelua. Tässä luentosarjassa tutustutaan eräisiin proteiinitutkimuksen keskeisiin menetelmiin ja esimerkkien valossa proteiinien rakenteen ja toiminnan suhteisiin erilaisissa biologisissa prosesseissa, sairauksissa ja bioteknisissä sovelluksissa. Luento-ohjelma vaihtelee vuosittain. Osa kurssista luennoidaan englanniksi. Luentojen seuraaminen edellyttää Biomolekyylien (51072) aiempaa suoritusta tai vastaavia tietoja. Luentosarjaan liittyy tentti, joka perustuu luennoilla esitettyyn aineistoon. Ilmoittautuminen ensimmäisellä luentokerralla. Luentoihin liittyviä kysymyksiä voit toimittaa mieluiten sähköpostitse: kari.keinanen-at-helsinki.fi

Luento-ohjelma keväällä 2005

Luennot salissa 1041 klo 10-12 (ma,ke) ja 8-10 (pe), poikkeuksena maanantai 20.4, jolloin luento on klo 11-13. Opinto-oppaan tekstistä poiketen luentoa EI OLE pe 8.4., pe 6.5. ja ke 18.5.

6.4. Proteiinien maailma. Johdatus luentosarjaan (Kari Keinänen, HY Biokemia)
11.4. Hermovälityksen rakennebiologiaa: glutamaattireseptorin toimintamekanismi (Kari Keinänen, HY Biokemia)
13.4. Entsyymikatalyysin orgaanista kemiaa (Jari Yli-Kauhaluoma, HY Farmasia)
15.4. Vasta-aineiden rakenteen muokkaus (Kristiina Takkinen, VTT Biotekniikka)
18.4. Crystallography for Pain and Pleasure. Part I.(Adrian Goldman, HY Biotekn.Inst.)
20.4. Crystallography for Pain and Pleasure. Part I.(Adrian Goldman, HY Biotekn.Inst.)
22.4. Optical Spectroscopy in Protein Research (Michael Verkhovsky, HY Biotekn.Inst.
25.4. Komplementtitekijä H:n kiderakenne ja rakenteen merkitys hemolyyttis-ureemisen oireyhtymän ymmärtämisessä (Veli-Pekka Jaakola, HY Biotekn.Inst.)
27.4. Virusten rakenne (Jaana Bamford, HY Biotekn.Inst.)
29.4. Denitrifikaation biokemiaa (Tuomas Haltia, HY Biokemia)
2.5. Protein Folding (Roman Tuma, HY Biotekn.Inst.)
4.5. Massaspektrometria ja sen käyttö proteomiikassa (Nisse Kalkkinen, HY Biotekn.Inst.)
9.5. Proteiinirakenteen mallinnus (Olli Pentikäinen, Åbo Akademi)
11.5. Integriinien rakenne ja toiminta (Minna Varis, HY Biokemia)
13.5. Tautimutaatiot proteiinikinaasien rakenne-toimintasuhteiden tutkimuksessa (Kaj Stenberg, HY Biokemia)
16.5. Proteiinien NMR-spektroskopia (Arto Annila, HY Biotekn.Inst ja Biokemia)
20.5. TENTTI

Tentit

Tentti 20.5. klo 10-12 salissa 1041. Uusintatentit biokemian yleisen tentin yhteydessä kesäkuussa ja syyskuussa. Uusintoihin on erikseen ilmoittauduttava biokemian osaston kansliaan Vuokko Paasolle (p. 19159025; vuokko.paaso-at-helsinki.fi).

Kirjallisuus

Luennot eivät noudata suoraan mitään oppikirjaa. Ainakin osasta luentoja luennoilla esitetty materiaali (esim. Powerpoint-esitykset) ilmestyy kansioon "PRT 2005", jonka löydät käytäväpöydältä biokemian osaston kansliaa vastapäätä (Viikinkaari 5, D-rappu, 3.krs)

Tänä vuonna on vielä mahdollista suorittaa tämä kurssi vaihtoehtoisesti kirjatenttinä. Tentti, johon on ilmoittauduttava erikseen biokemian osaston kansliaan, perustuu kirjaan Bränden & Tooze: Introduction to Protein Structure (2. laitos, Garland, 1999; kpl:eet 8-18). Tenttimahdollisuus on biokemian yleisinä tenttipäivänä touko-, kesä- ja elokuussa.
Syyslukukaudesta 2005 alkaen oppikirjaksi vaihdetaan Whitford: Proteins. Structure & Function, Wiley, 2005.

Hyödyllisiä linkkejä

  • Protein Data Bank: proteiinirakennetietokanta (ks.myös Education-linkki)
  • ExPASy: proteiinitutkimuksen tietokanta ja portaali sekvenssianalyysiin (varsinainen aarreaitta!)

    • Takaisin

    Päivitetty viimeksi 23.10.2005 (Kari Keinänen)